Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Q3U6N9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Q3U6N9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q3U6N9 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms