Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf5P56477 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irf5P56477 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf5P56477 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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