Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms