Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm13527-201ENSMUST00000117926 691 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm13864-201ENSMUST00000119745 785 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 1700021N21Rik-201ENSMUST00000131110 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm44920-201ENSMUST00000206503 746 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mif-201ENSMUST00000038169 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm26397-201ENSMUST00000083703 134 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm8848-201ENSMUST00000197270 1343 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 Gm13861-201ENSMUST00000137136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 Gm28676-201ENSMUST00000188990 591 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Zfp640-201ENSMUST00000071320 894 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 Gm14264-201ENSMUST00000147141 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Nr1h4-202ENSMUST00000105296 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PtprmP28828 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprmP28828 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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