Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RarbP22605 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RarbP22605 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RarbP22605 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RarbP22605 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
RarbP22605 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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