Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Rdh7-201ENSMUST00000047199 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Defa-rs1P17533 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Defa-rs1P17533 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Zkscan7-205ENSMUST00000216462 990 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 AC122357.1-202ENSMUST00000221436 633 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Olfr1329-201ENSMUST00000071979 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa-rs1P17533 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms