Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zbtb34-202ENSMUST00000113158 6602 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ccdc47-201ENSMUST00000002043 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Bfar-202ENSMUST00000069281 2456 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Platr9-202ENSMUST00000149572 1556 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Vpreb1P13372 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms