Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-AaP01910 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-AaP01910 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms