Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3371F7CQW8 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms