Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Trav9n-1-201ENSMUST00000185224 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm7924-201ENSMUST00000203975 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ang2-202ENSMUST00000228835 896 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Tspy-ps-203ENSMUST00000186546 989 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc8E9PWG2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms