Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b5A3FIN4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atp8b5A3FIN4 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b5A3FIN4 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms