Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Hdac5Q9Z2V6 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms