Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Smg9Q9DB90 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smg9Q9DB90 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms