Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn22Q9D7U6 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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