Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Nop56Q9D6Z1 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nop56Q9D6Z1 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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