Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Klhdc8bQ9D2D9 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Klhdc8bQ9D2D9 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms