Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Use1Q9CQ56 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Use1Q9CQ56 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms