Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TardbpQ921F2 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms