Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Dnajc28Q8VCE1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Dnajc28Q8VCE1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Dnajc28Q8VCE1 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Dnajc28Q8VCE1 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms