Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Fibp-201ENSMUST00000025847 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Rpl7a-ps13-201ENSMUST00000121692 563 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm13377-201ENSMUST00000137984 683 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 AC158122.1-201ENSMUST00000227398 673 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 1700013G24Rik-201ENSMUST00000048893 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Vmn1r44-203ENSMUST00000226120 1772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm13527-201ENSMUST00000117926 691 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm3752-202ENSMUST00000167833 450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm10128-201ENSMUST00000171360 615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm2956-202ENSMUST00000178722 450 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm10340-202ENSMUST00000188235 615 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Tmbim7-201ENSMUST00000014673 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 1700057H15Rik-202ENSMUST00000143859 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm29617-201ENSMUST00000185730 610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Gm9771-201ENSMUST00000198267 1137 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Crygc-201ENSMUST00000027089 783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NischQ80TM9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NischQ80TM9 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms