Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm5460Q3UQ97 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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