Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skap2Q3UND0 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Skap2Q3UND0 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms