Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp30Q3UN04 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms