Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ttc21bQ0HA38 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ttc21bQ0HA38 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ttc21bQ0HA38 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ttc21bQ0HA38 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ttc21bQ0HA38 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ttc21bQ0HA38 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms