Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpbP50405 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SftpbP50405 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpbP50405 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms