Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SrprbP47758 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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SrprbP47758 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SrprbP47758 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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SrprbP47758 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrprbP47758 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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