Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl3P27659 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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