Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H2-Eb1P04230 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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