Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PtprfA2A8L5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms