Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac5Q9Z2V6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.1 ms