Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rnf6Q9DBU5 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rnf6Q9DBU5 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rnf6Q9DBU5 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rnf6Q9DBU5 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rnf6Q9DBU5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms