Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Fcf1Q9CTH6 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms