Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf144aQ925F3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf144aQ925F3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms