Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Lyrm1-204ENSMUST00000106518 875 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm12011-201ENSMUST00000119734 618 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Usp54Q8BL06 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Usp54Q8BL06 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Usp54Q8BL06 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usp54Q8BL06 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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