Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Irf5P56477 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Irf5P56477 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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