Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrprbP47758 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms