Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Irf1P15314 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms