Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm2056J3QQ02 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms