Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gm2035J3QP87 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms