Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm4871D3Z0W7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm4871D3Z0W7 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm4871D3Z0W7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm4871D3Z0W7 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Gm4871D3Z0W7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4871D3Z0W7 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Gm4871D3Z0W7 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm4871D3Z0W7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm4871D3Z0W7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm4871D3Z0W7 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4871D3Z0W7 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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