Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprfA2A8L5 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms