Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 H2-M10.5-201ENSMUST00000041531 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mup9-201ENSMUST00000107506 721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Tspan2-202ENSMUST00000119902 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm12146-201ENSMUST00000127604 518 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Riok3Q9DBU3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Riok3Q9DBU3 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms