Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc97Q9DBT3 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms