Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rexo2Q9D8S4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms