Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tubgcp4Q9D4F8 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms