Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Snx29Q9D3S3 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Snx29Q9D3S3 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Snx29Q9D3S3 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Snx29Q9D3S3 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx29Q9D3S3 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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