Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gins4Q99LZ3 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gins4Q99LZ3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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