Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pacsin3Q99JB8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms