Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apobec3Q99J72 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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