Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dnajc28Q8VCE1 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms